перемещаю эти файлы в другую папку на диске С и там часть файлов отображается без эскизов..
Эта папка была также давно создана? Что-то нарушило все же права доступа- у меня только такое объяснение, так как в новых папках все ок работает.
Не думаю, что это ACDSee. Возможно, что тут даже не в правах доступа проблема, а в каких-то метаданных, вот их сторонний софт мог стереть запросто, а в новую папку перемещаете и они восстанавливаются у файлов.
Не думаю, что нужно еще какие-то более глобальные действия делать и обновлять систему с образа. Если бы было серьезное нарушение, что ничего бы не помогало.
Как-то так.