Долгая загрузка системы Win8.1 + Невозможность войти в учетную запись Microsoft

Пока рано. Давайте попробуем выполнить чистый запуск windows и повторить восстановление. Есть антивирусы в которых надо отключать превентивную защиту и самозащиту. Если у вас продукт компании Dr.Web, то его надо удалить,  (сохраните ключ и настройки),чистый запуск с ним не проходит. Есть второй вариант и менее болезненный. Правый нижний угол, перезагружаемся с зажатой клавишей shift, и попадаем в меню, таким способом выгрузив лишний софт восстанавливаем систему.      

После перезагрузки:

Нажимаете F10 и там найдете восстановление системы. Если этот способ не сработает, то вариантов останется не много.

Чувствую мне придётся делать чистую установку...

Я бы снял галку с очистки главной файловой таблицы (MFT). Думаю ССleaner свою задачу выполнил на все 100%. У меня это чудо не установлено, но предполагаю, что настройки для браузера тут:

Если есть точка восстановления, откатитесь назад, потом удалите ССleaner и забудьте про эту программу. Она на windows xp чудила, про windows 8/8.1 вообще молчу... Как показывает практика, система работает стабильней и живет дольше у тех, кто не пользуется оптимизаторами, твикерами и чистилками. А если пользуетесь, то по крайней мере надо понимать, что вы делаете и где ставите галки.

Еще только что обнаружил, что практически все приложения и игры после загрузочного экрана вылетают. Только предустановленные в норме. Чувствую что у меня что-то серьёзное случилось :(

Я и так только IE 11 пользуюсь :) Вот на счет галочек не знаю, вот какие стоят у меня:

Просто странно. Всегда было всё в порядке, 3 дня перед этим вроде не делал ничего, чтобы тормознуло всё так, просто ни с того, ни с сего :(