Microsoft 365 Familyの共有を解除してPersonalへ切り替えたい

おそらく大丈夫だと思いますがリスクは常にいつもありますね。何がおこるかわからない（予期せず新しいサブスクリプションが紐付がない状態が長く続いたり、切替できない状態に陥いってしまうなど）ので、別途管理されている状態にあるだろう外付けのドライブなどへのバックアップが正常で、何が起こっても必要なデータはすべて直ちに回復可能な状態であるか確認しておいた方がよいでしょう。また、これを期にバックアップのバックアップなど、他の方法で管理されているバックアップも確認しておいた方がよいかもしれませんね。OneDriveクラウドストレージだけに頼ると大変なことになるかもしれません。

Microsoftストレージを購入した場合、容量はリアルタイムで反映されますが容量超過などでの制限解除には48時間程度要している様です。
短時間の話なのでファイル削除はされないでしょうけど、一時的なファイルロックはあるかも？
Microsoft ストレージ クォータ

OneDrive利用時には、外部媒体などにバックアップを作成しておいてください。
それがあれば暫定対策にもなりますよね。
それを怠ってOneDriveトラブルなどでファイル消失される方も一定数いらっしゃいます。