TomoSuzu さん
パソコンから出力する音もイヤホンジャックから出力しているということですが、
マイクのプロパティからこのデバイスを聴くという項目のチェックをONにしているということでしょうか?
そうであれば雑音のような感じになるのも仕方ないと思いますよ。
上記が関係なければ、一度ヤマハのページのQAも参考にしてみてください。
http://yamaha.custhelp.com/app/answers/list/search/1/kw/%E3%83%8E%E3%82%A4%E3%82%BA/suggested/1