Нет, винду сбрасывать пока не надо. Выполните следующие действия:
- Отключите от ПК физический диск С, а диск D оставьте подключенным.
- Запустите ПК с загрузочной флэшки. На экране выбора места установки удалите раздел на D (он может быть уже "под другим именем", но на это можно не обращать внимания).
- На освободившемся пространстве создайте раздел во весь объем диска. Отформатируйте новый раздел.
- После форматирования - прервите установку (отключите ПК длительным нажатием кнопки вкл/выкл и извлеките флэшку).
- Обратно подключите к ПК диск С.
- Запустите ПК как обычно и проверьте, как дела на "проблемном" диске.