При первом запуске после отключения модуля необходимо было восстановить пин код. В остальном все работало как и прежде. С проблемой я разобрался. На Reddit нашел статью с такой же проблемой как у меня и почитав комментарии понял что проблема в фирменных утилитах Gigabyte. Удалил их все, в том числе и Appcentr, перепрошил матплату тем же биосом с сайта, после включения и первоначальной настройки включил fTPM и все загрузилось. Но, если вернуть фирменные утилиты, через пару дней проблема повторилась. После чего именно это происходит, не понятно, т.к. сразу после установки утилит и перезагрузки все работает нормально. Написал в техподдержку Gigabyte, пока жду ответа. Но судя по комментариям на Reddit все что они скажут это попробуйте переустановить систему.
PS По поводу статьи выше, когда система запускается с выключенным TPM любые функции которые так или иначе задействуют его, в т.ч. и очистка пишут что модуль не установлен или не включен в системе. А если включить его, то постоянно будет появляться экран с ошибкой 0xc00000e9 (любые нажатия клавиш вроде перехода в режим восстановления, или попробовать еще раз, ни к чему не приводят, экран моргает и ошибка появляется снова, работает только перезагрузка) При чем что интересно, если включен быстрый запуск, то не активна даже клавиатура, т.е. нажать попросту ничего не возможно (у меня нет разъёма PS/2, а любые USB клавиатуры оставались не активными).