Olá Carlõ,
Ao tentar elevar o Nível Funcional da Floresta, se houver um objeto de controlador de domínio obsoleto na partição de configuração, o AD bloqueia a operação porque ainda reconhece metadados de um DC inexistente. O procedimento recomendado é utilizar o ntdsutil para remover esses metadados. Abra uma sessão com privilégios elevados, execute ntdsutil, digite metadata cleanup, selecione o domínio e o controlador de domínio antigos e remova-os. Isso elimina as referências no AD, incluindo objetos em CN=Configuration,DC=<forest> e entradas em Sites e Serviços.
Após a limpeza, confirme em Sites e Serviços do Active Directory se não restaram servidores órfãos e, no Gerenciador de DNS, se não há registros SRV ou A associados ao DC removido. Também é importante verificar se todas as funções FSMO estão atribuídas a controladores ativos (netdom query fsmo) e se não há dependências quebradas. Somente após garantir a consistência do diretório é seguro tentar elevar novamente o nível funcional da floresta.
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Domic.