２つあるMicrosoftアカウントの１つを削除または無効化の方法

下記を参照してみてください。
Microsoftアカウントの使用を停止する方法

このサイトでも同じ質問が繰り返し出ていますが、二段階認証（セキュリティ報連絡先）を含めて書き換えられている場合は解決することは難しいと思います。
下のサイトを参照して、「サインイン ヘルパー ツール」あるいは「アカウントの回復フォーム（2 段階認証が有効になっている場合は使えない）」を試してみてください。
マイクロソフトのサポート窓口で相談する方法もありますが、それで解決できるかどうかは分かりません。
　　Microsoft アカウントにサインインできない
　　Microsoft アカウント回復フォームのヘルプ
　　マイクロソフト サポートの利用方法
　　Microsoft の電話サポートについて

解決しない場合は被害を防ぐため、アカウントに関連しているものがあれば必要な対策を取った方がいいと思います。
　クレジットカードについてはクレジット会社に相談する。
　ネット銀行、ネット証券、ネット通販などについては、ID やパスワードを変更する。
　被害が予想される場合は警察に相談してください。
　　警察庁：不正アクセス対策

ハッキングの被害に逢って、あなたはサインインできず、乗っ取ったハッカーはそのアカウントの管理権限を取得している場合、Microsoft から見てハッカーの方が正当なアカウントの所有者とみなされるので、そのアカウントに対してあなたが何かのリクエストをしても対応はされません。乗っ取られたことを証明するには、アカウントの回復フォームを利用するしかありませんが、かなり困難だと思います。

二次被害を防ぐという意味では、そのアカウントにリンクしていたサービスや支払い情報などの側で、リンクを解除する、クレジットカード会社に相談してカード再発行などの対処をする、といった対応を行ってください。実際の被害がある場合は警察への相談や被害届も行ってください。