ユーザーがノートを電子的にキャプチャ、整理、再利用できるようにする Microsoft 製品のファミリ。
OneNoteのWebアプリでは正常に開けて、ノートブックは欠落なく正常にアクセスできるわけですね。
OneNoteのデスクトップアプリのキャッシュが壊れているのかもしれないので、キャッシュをクリアするために全てのノーブックを閉じた状態でアプリを再起動してみてはどうでしょう?
■メニューのファイルで表示されるノートブック情報の画面で一度すべてのノートブックを設定のプルダウンメニューから閉じて、OneNoteデスクトップアプリを閉じて(終了して)、もう一度、アプリを起動してノートブックを開き直してみてはどうでしょう。
■うまく、キャッシュをクリアできないときは、全てのノーブックを閉じた状態でアプリを終了してから、直接エクスプスローラーでキャッシュを表示して、キャッシュ(オプションの「保存とバックアップ」でキャシュファイルのある場所がわかります)を削除してみてはどうでしょう。