WindowsPCで、メールから共有されたPowerPointを開いたのですが、Web版であったので、大学のマイクロソフトアカウントでサインインを試みようとしたところ、「問題が発生しました」と出てきて、サインインできませんでした。

個人のMicrosoftアカウント／大学のMicrosoft365アカウントのどちらに共有されたファイルですか？
ブラウザにて双方のアカウントを利用している場合は、メールのリンクをクリックするのではなく、利用したいアカウントでサインインしている状態でブラウザにURLをペーストして下さい。
個人アカウント
大学アカウント

ブラウザ関連での一般的なトラブルシューティングも試して見てください。
・inPrivate(シークレット)ウィンドウで試してみて下さい
・ブラウザのcookie・キャッシュ・履歴を全て全期間削除してみて下さい
・ブラウザの拡張機能を利用されている場合は、一時的に無効にしてみて下さい
・別ブラウザで試してみて下さい
・Defender以外のセキュリティ系アプリを利用されていたらアンインストールしてみて下さい
・可能であれば、利用するインターネット回線(自宅LAN→スマホ回線など)を変えてみて下さい

メールから共有されたPowerPoint

誰から（同じ大学のアカウントのユーザー、外部の組織のメンバー、個人）、どんな場所に共有されているファイルを共有されたのでしょう？

大学のマイクロソフトアカウントでサインインを試みようとした

実際に「試みた」のでしょうか？ 共有ファイルのリンクをクリックすると。Microsoft のアカウントでのサインインを求められたのでしょうか？

可能であれば、そのサインイン求められた画面のスクリーンショットを投稿してください。

同じ「大学のマイクロソフトアカウント」で他の場所へのサインインは問題なく行えますか？