通常の出荷時の構成(HP の販売時の初期状態)であれば、システムで予約済みのパーティションの空き容量が不足することは無いはず(そうならないように HP 側でも検証している)ですが、サードパーティ製のツールなどが予約済みパーティションに書き込みを行う場合があり、その結果として容量が不足することがあります。このような状況では HP も(サードパーティ製品に起因する問題なので)対処ができませんので、初期化を指示するのは仕方ないと思います。
原因となるサードパーティ製品が確認できれば対処のしようもありますが、おそらくそれは分からないと思いますので、サードパーティ製のパーティション操作ツールを利用するか、初期化が有効な対処でしょう。