_namikawa_ さん、こんにちは。
マイクロソフト コミュニティ への投稿ありがとうございます。
Windows Server 2008 R2 で 言語バーが表示されず、日本語入力が出来なくて困っているので、これを改善する方法を知りたいとの質問ですね。
Windows Server 2008 R2 と Windows 7 はベースが同じで、操作も似ているため、ひょっとしたらクライアント OS の対処方法で改善できるかもしれません。
いくつか参考になりそうな情報を紹介します。
(すでに確認済みの場合には、すみません)
・ Windows Vista でデスクトップにあった言語バーが消えた!?
当フォーラムは Windows 7、Vista などのクライアント OS についての情報交換の場となっています。
サーバー環境の場合には情報が集まりにくいかもしれませんので、TechNet の Windows 2008 Server フォーラム を利用するのもよいかもしれませんよ。