リンク先の内容は見ていないのですが、%SystemRoot%\Profiles\Username はWindows NTの場合になります。
Windows XPでは、%SystemRoot%\Document and Settings\Username になります(%USERPROFILE%とも表すことができます)。
レジストリソフトできれいにとのことですが、実際にはきれいにしても効果はあまりなく、逆に必要なレジストリまで消えてしまい動作がおかしくなったという書き込みもよく見かけますので、あまりお勧めはしませんが・・・