Je ne comprends pas du tout votre réponse ni ce qu'il faut faire. Sur le disque dur (Explorateur windows) une bonne partie des dossiers est mentionnée comme synchronisée :  pour déplacer le fichier en dehors de votre dossier OneDrive vers un autre dossier sur le disque dur.
Il ne faut pas supprimer le dossier sur Onedrive mais juste décochez le dossier conteneur sur Onedrive.
Ce sont les fichiers contenus dans le dossier Onedrive qui seront supprimés pas les dossiers contenus sur votre disque dur , je répète , il ne faut pas confondre les dossiers de synchronisation Onedrive et vos dossiers personnels contenus sur votre disque dur .
Toutes les actions que vous effectuez avec Onedrive sont en rapport avec les dossiers Onedrive .
Donc effectuez une copie de tout les fichiers contenus dans les dossiers Onedrive et les copier sur votre Bureau par exemple , effectuez un test vous y verrez plus clair ainsi.
J'espère que vous ai compris et j'espère avoir pu me faire comprendre.